องค์การบริหารส่วนตำบลวัฒนานคร ได้รับการยกฐานะจากสภาตำบลวัฒนานครเป็นองค์การบริหารส่วนตำบลและมีฐานะเป็นนิติบุคคล และเป็นราชการบริหารส่วนท้องถิ่น ตามพระราชบัญญัติสภาตำบลและองค์การบริหารส่วนตำบล พ.ศ. 2537 ตามประกาศกระทรวงมหาดไทย เรื่อง การจัดตั้งองค์การบริหารส่วนตำบล เมื่อวันที่ 16 ธันวาคม 2539 โดยมีการประกาศในราชกิจจานุเบกษา เล่ม ๑๑๓ ตอนพิเศษ ๕๒ ลงวันที่ 25 ธันวาคม ๒๕๓๙ โดยมีวาระการดำรงตำแหน่งของผู้บริหารองค์การบริหารส่วนตำบลวัฒนานคร ดังรายนามต่อไปนี้
1. นางขวัญเรือน เทียนทอง
ดำรงตำแหน่งประธานกรรมการบริหารฯ ตั้งแต่ 2540 - 2544
2. นายมานิต อุ้มแก้ว
ดำรงตำแหน่งประธานกรรมการบริหารฯ ตั้งแต่ 2545 - 30 มิถุนายน 2548
3. นายมานิต อุ้มแก้ว
ดำรงตำแหน่งนายกองค์การบริหารส่วนตำบลวัฒนานคร ตั้งแต่ 15 สิงหาคม 2548 - 30 กรกฎาคม 2552
ดำรงตำแหน่งนายกองค์การบริหารส่วนตำบลวัฒนานคร ตั้งแต่6 กันยายน 2552 - 30 กันยายน 2564
4. นายประยูร เรียเต็ม
5.นายอภิสิทธิ์ ปิ่นศิริวัฒนา
ดำรงตำแหน่งนายกองค์การบริหารส่วนตำบลวัฒนานคร ตั้งแต่ 28 พฤศจิกายน 2564 - ปัจจุบัน
